More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3108 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  38.38 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.61 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.35 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  34.47 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  34.32 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.01 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  33.73 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  33.64 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  32.52 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.9 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 203 aa  95.1  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.91 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  32.14 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.17 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  25.24 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.23 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.54 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1979  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.58 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1894  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.58 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.323846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  28.25 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.35 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1984  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.15 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.543925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.51 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  27.55 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  26.15 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  25.76 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 		 308 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  26.29 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.64 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.55 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.59 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.56 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.85 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.56 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  27.23 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.87 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  26.84 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  26.84 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  24.44 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  25.84 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  24.44 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 480 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  24.77 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.57 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.71 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.51 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>