More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4090 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 464 aa  846    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 		 515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  42.32 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  48.62 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  41.48 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 498 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  42.57 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 504 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 465 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  30.72 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  38.55 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 496 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  32.58 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 		 541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  31.41 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.4 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  29.46 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 474 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  34.37 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 531 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.07 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.4 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.4 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.4 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  29.44 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  29.44 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 538 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 497 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 		 549 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 506 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 467 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 467 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.33 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.82 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.92 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.67 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 476 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  23.81 
 
 		 507 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 539 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 487 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.57 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.57 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  23.57 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.3 
 
 		 531 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 		 502 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 504 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>