More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3150 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  68.84 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  70.92 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.41 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  62.86 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  60.31 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.12 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.22 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 160 aa  156  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 193 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 193 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 193 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 193 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.86 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 152 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 179 aa  143  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  51.11 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  51.88 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 162 aa  139  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.21 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.06 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  46.38 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>