184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0660 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  100 
 
 		 302 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.14 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.52 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  31.72 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  32.52 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.22 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.68 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  32.22 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  30.14 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  27.94 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.11 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  40.56 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.78 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.56 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.19 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  27.53 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  35.48 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  34.03 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  26.72 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  38.92 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.56 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.62 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  25.94 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  25.94 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  28.98 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.38 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  30.97 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  28.94 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  35.32 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  39.71 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  30.28 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  26.82 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.81 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  24.82 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  34.01 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.46 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  29.14 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  22.9 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  28.51 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  34 
 
 		 393 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  29.65 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.02 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  32.69 
 
 		 159 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  29.82 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  33.95 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  28.84 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  40.34 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.85 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  37.86 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  27.37 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  30.73 
 
 		 381 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  28.88 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  36.67 
 
 		 159 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>