171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2549 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  100 
 
 
271 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  72.22 
 
 
274 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  45.08 
 
 
279 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  43.66 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  38.29 
 
 
272 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  41.91 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  31.5 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  31.5 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  33.46 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  33.46 
 
 
266 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  36.84 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  36.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
266 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 
288 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.34 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.7 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  26.02 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  25.65 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  25.65 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.92 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.31 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.06 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.93 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.27 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.72 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  29.64 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  29.14 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.18 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  26.86 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.18 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.18 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.44 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  27.53 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  28.62 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  28.67 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.7 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
293 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  28.42 
 
 
277 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  27.34 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.16 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  28.78 
 
 
282 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  26.62 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.31 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  29.2 
 
 
144 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  26.28 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  26.83 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  27.83 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  26.69 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
381 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  31.65 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  27.94 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  27.13 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  26.15 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  28.84 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  32.88 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  26.12 
 
 
323 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  29.5 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  29.18 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  26.6 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  26.6 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>