148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4996 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  69.87 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  34.6 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  33.46 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  33.07 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  33.07 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  34.74 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.6 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  28.83 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  30.42 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  30.65 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  30.85 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.89 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  37.24 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.33 
 
 		 285 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.09 
 
 		 303 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.72 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.43 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.04 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.7 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  27.88 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.73 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.89 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  27.01 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  27.51 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  27.3 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.83 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  38.02 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.74 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.29 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.57 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.39 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  30.56 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.62 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.51 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  39.06 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  37.18 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.65 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  27.87 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  27.88 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  28.01 
 
 		 288 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  27.43 
 
 		 294 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  27.43 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  27.43 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  27.43 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.27 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  33.81 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  27.43 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  31.97 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  31.94 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>