262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1104 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  97.73 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  50.94 
 
 		 272 aa  251  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  48.69 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  47.94 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  44.32 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  44.32 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  44.32 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  36.64 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  35.41 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  36.73 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.18 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.86 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 293 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.18 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.1 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.1 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  31.64 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.3 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.8 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  27.55 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.92 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  26.37 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  26.79 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  27.57 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  27.51 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  27.37 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  28.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.12 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  25.27 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  32.08 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  29.75 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  29.63 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  29.29 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.23 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  31.44 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  25.09 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  28.82 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  29.23 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.97 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  31.02 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  38.69 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.1 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  30.6 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  25.72 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.51 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  33.16 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.82 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  28.83 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.41 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  26.33 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  25.65 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  28.57 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.47 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  29.15 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.47 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  29.91 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.61 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>