110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1381 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  69.87 
 
 
246 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  32.82 
 
 
272 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  36.76 
 
 
299 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
299 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
299 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  31.15 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  30.65 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  30.65 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  32.23 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  31.6 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  33.17 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  31.58 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.49 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  39.29 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.66 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.87 
 
 
292 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
292 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
292 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  26.61 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.07 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  29.06 
 
 
302 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  29.65 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
143 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  29.88 
 
 
386 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  33.5 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.39 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  28.82 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.19 
 
 
294 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.32 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.11 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.81 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.97 
 
 
292 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.58 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.02 
 
 
293 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 
300 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.85 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  28.41 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
289 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.77 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  30.71 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 
166 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.7 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  30 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  29.14 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.65 
 
 
303 aa  49.3  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  26.46 
 
 
292 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
293 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  28.8 
 
 
299 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  29.92 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  28.47 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  35.29 
 
 
142 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  26.39 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  25.96 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.05 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  25.58 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2140  hypothetical protein  58.14 
 
 
415 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  33.08 
 
 
183 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  31.08 
 
 
296 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  29.05 
 
 
308 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  26.72 
 
 
295 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  25.89 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  25.89 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30 
 
 
345 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  30.2 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.93 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.78 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  32.61 
 
 
140 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  29.86 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>