More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2233 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 316 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  34.19 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  34.19 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  33.48 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  33.48 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.85 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  30.56 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  37.91 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.92 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  34.82 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  31.79 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  32.98 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  38.98 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  28.35 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  33.03 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  29.92 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  35.25 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.59 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  30.52 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  28.95 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.7 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  28.77 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  32.67 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  25.96 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.26 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.29 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  29.5 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>