199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2183 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 409 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  63.3 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.23 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  53.62 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  44.39 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  44.76 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.97 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.65 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  41.69 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  37.05 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  34.35 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.79 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  36.01 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  34.81 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  34.81 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  34.81 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  30.99 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  35.52 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  31.47 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  28.61 
 
 		 370 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.74 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.74 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.74 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.32 
 
 		 739 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.9 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 		 741 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.9 
 
 		 741 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.9 
 
 		 741 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.45 
 
 		 735 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.79 
 
 		 740 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.79 
 
 		 732 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.75 
 
 		 736 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  27.84 
 
 		 740 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.57 
 
 		 741 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.51 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.47 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  26.47 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  23.85 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  25.93 
 
 		 736 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  26.41 
 
 		 727 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  24.58 
 
 		 736 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  26.67 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.96 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  25 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.89 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  26.94 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  22.82 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.12 
 
 		 719 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  25.76 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  25.23 
 
 		 750 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  26.27 
 
 		 740 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.16 
 
 		 719 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.16 
 
 		 719 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.16 
 
 		 719 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  25.75 
 
 		 719 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.47 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.8 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  24.89 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  22.88 
 
 		 781 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.88 
 
 		 780 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 		 747 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  24.52 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  24.45 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  22.65 
 
 		 784 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  24.45 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.24 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  25.31 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  26.36 
 
 		 722 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  20.43 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.35 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  24.68 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.57 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  22.95 
 
 		 749 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.05 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  22.02 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  23.08 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25.58 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  24.23 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  24.23 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  23.85 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.79 
 
 		 720 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.2 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>