83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2610 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
373 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.87 
 
 
368 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  36.29 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  31.32 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  31.04 
 
 
372 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  31.04 
 
 
372 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  30.48 
 
 
371 aa  208  9e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  32.87 
 
 
382 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  32.87 
 
 
382 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  33.15 
 
 
378 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.49 
 
 
383 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  30.35 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  28.97 
 
 
372 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  27.92 
 
 
483 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  29.4 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.25 
 
 
436 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  28.23 
 
 
381 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  30.79 
 
 
365 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  29.78 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  30.33 
 
 
388 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
385 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  29 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.63 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  26.65 
 
 
380 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  27.05 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  27.6 
 
 
382 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  27.6 
 
 
382 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  26.2 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  26.2 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  26.2 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  26.2 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.4 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  26.2 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  26.2 
 
 
465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  26.3 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  28.53 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.27 
 
 
413 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
433 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  24.33 
 
 
379 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
436 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.58 
 
 
413 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.8 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
413 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.13 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.25 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  24.33 
 
 
611 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.21 
 
 
411 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  25.84 
 
 
413 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.02 
 
 
416 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  25.41 
 
 
652 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  20.5 
 
 
415 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  27.64 
 
 
407 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.54 
 
 
421 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  28.96 
 
 
385 aa  99.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.8 
 
 
430 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.38 
 
 
414 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.26 
 
 
448 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  24.8 
 
 
491 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.68 
 
 
448 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.68 
 
 
448 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.11 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.44 
 
 
413 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  25.78 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.16 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
442 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  22.64 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.42 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  24.22 
 
 
585 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  22.5 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  24.09 
 
 
569 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  23.78 
 
 
579 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  22.16 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  21.33 
 
 
590 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.15 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  20.52 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  20.55 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.45 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>