More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2713 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  60.4 
 
 
252 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 
233 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  54.77 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  56.02 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  53.67 
 
 
248 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.98 
 
 
236 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
279 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
274 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  46.25 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.52 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 
296 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.73 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
267 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 
260 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
296 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
282 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.24 
 
 
242 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 
278 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 
277 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  50.82 
 
 
246 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.6 
 
 
284 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.68 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 
273 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
280 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  37.56 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
254 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
266 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
285 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 
285 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
285 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 
258 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.98 
 
 
307 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
270 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 
267 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
260 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  50.45 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
261 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  48.89 
 
 
275 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  48.91 
 
 
271 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 
261 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  43.92 
 
 
208 aa  108  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 
293 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  37.95 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.98 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  28.72 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
475 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  35.43 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 
290 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
271 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  35.33 
 
 
306 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  32.06 
 
 
281 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44 
 
 
265 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  48.44 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  48.44 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.3 
 
 
265 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 
284 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
272 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  48.44 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
268 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>