248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2383 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 411 aa  799    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  59.71 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  57.21 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  61.87 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  54.61 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.13 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  55.1 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  53.64 
 
 		 416 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  51.94 
 
 		 416 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  52.64 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.48 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  51.7 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  46.02 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  41.65 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  43.52 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  42.79 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  39.13 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  39.56 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  39.81 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  38.54 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  38.54 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  38.54 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.32 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.54 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  38.79 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  38.17 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  38.65 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  38.65 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  37.26 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  38.08 
 
 		 418 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  37.47 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  39.24 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  37.65 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  38.41 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  36.18 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  36.56 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  36.92 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.59 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  35.58 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  37.37 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  37.67 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  37.02 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.51 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  36.21 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  37.11 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  35.34 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  36.41 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.61 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.66 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  35.97 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  38.76 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  38.1 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  34.06 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  37.85 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  34.87 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  35.11 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  36.1 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  36.25 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  35.96 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  37.74 
 
 		 401 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  38.08 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  36.21 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  35.85 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.83 
 
 		 413 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  36.3 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  34.62 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.8 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  36.65 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  36.41 
 
 		 403 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  36.1 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  36.3 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  36.1 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  36.1 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  34.39 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  36.1 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  36.1 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  36.07 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  36.07 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  34.53 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  37.26 
 
 		 425 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  34.47 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  37.69 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  33.97 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  35.85 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  33.88 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  36.3 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  37.56 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  34.59 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  33.18 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.32 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  33.8 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.49 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  34.2 
 
 		 416 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.49 
 
 		 566 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  33.65 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  33.88 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>