58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1472 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 378 aa  758    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  59.72 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  54.69 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  54.69 
 
 		 374 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  54.42 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  54.64 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  53.17 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  49.21 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  48.68 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  48.15 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  33.25 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  30 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.58 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.72 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.36 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  27.08 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  29.12 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.99 
 
 		 434 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.62 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.34 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.18 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  23.9 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0137  putative permease  24.16 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  23.6 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  30.43 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.9 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  24.56 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.89 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  21.99 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.23 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.74 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.54 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.51 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.29 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  22.89 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  22.89 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  22.08 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.84 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.64 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.27 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.32 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.14 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.54 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.94 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.24 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.95 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  27.14 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>