174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0551 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 
195 aa  386  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  71.79 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  61.34 
 
 
192 aa  225  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  57.22 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  59.67 
 
 
196 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  42.46 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  40.11 
 
 
205 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  38.89 
 
 
197 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  36.96 
 
 
204 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  37.91 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  34.57 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  35.94 
 
 
261 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  36.76 
 
 
360 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  34.9 
 
 
256 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  34.97 
 
 
218 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  38.07 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  34.86 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  34.07 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  35.14 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.94 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  35.23 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  36.96 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  31.52 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  34.66 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  33.7 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  34.36 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  35.58 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.24 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  33.7 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  32.99 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  32.95 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  32.97 
 
 
270 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  36.97 
 
 
302 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  32.07 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  29.84 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  34.68 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  31.41 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  31.41 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  31.89 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  31.25 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  31.09 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  27.54 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  28.42 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  30.85 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  32.12 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  32.99 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.08 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  31.91 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  33.69 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  33.16 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  31.94 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  30.85 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  36.22 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.11 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  30 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.48 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  47.5 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  29.41 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  28.11 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  28.95 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  30.35 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  30.29 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  27.96 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  32.24 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  31.75 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  28.72 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  26 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  31.34 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  31.87 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  31.87 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  31.75 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  31.38 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  29.94 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  29.19 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  31.61 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.38 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  32.62 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.84 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  28.72 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  26.07 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  31.75 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  29.59 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>