183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2516 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
479 aa  941    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  54.23 
 
 
486 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.18 
 
 
492 aa  310  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  35.02 
 
 
492 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  35.53 
 
 
517 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  34.77 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.77 
 
 
497 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  35.21 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  34.2 
 
 
496 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.65 
 
 
502 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  34.04 
 
 
500 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.33 
 
 
503 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  32.57 
 
 
482 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  35.01 
 
 
494 aa  237  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  35.5 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  31.01 
 
 
497 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  33.4 
 
 
502 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  29.96 
 
 
524 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  30.83 
 
 
499 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.2 
 
 
489 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  30.43 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.98 
 
 
485 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  32.49 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  32.49 
 
 
502 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  32.29 
 
 
503 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  31.82 
 
 
503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  32.28 
 
 
502 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  32.28 
 
 
502 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  30.53 
 
 
516 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.96 
 
 
494 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  31.15 
 
 
503 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  31.31 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  31.87 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.25 
 
 
536 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.37 
 
 
502 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  30.91 
 
 
483 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.89 
 
 
499 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.72 
 
 
516 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.72 
 
 
516 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  33.26 
 
 
532 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  30.82 
 
 
502 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.72 
 
 
516 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.04 
 
 
494 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.59 
 
 
493 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.29 
 
 
518 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.29 
 
 
518 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.15 
 
 
543 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.08 
 
 
483 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  28.73 
 
 
484 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.02 
 
 
520 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.16 
 
 
497 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  28.69 
 
 
484 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  28.69 
 
 
484 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.68 
 
 
505 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.38 
 
 
494 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  28.18 
 
 
484 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  32.29 
 
 
496 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.59 
 
 
514 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.27 
 
 
514 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  32.29 
 
 
496 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.23 
 
 
494 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.23 
 
 
494 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.23 
 
 
494 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.42 
 
 
547 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.58 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.63 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  28.95 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  28.95 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.28 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.32 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  28.51 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  28.95 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  28.95 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  28.73 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.26 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  28.95 
 
 
484 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  30.82 
 
 
575 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.22 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.69 
 
 
490 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.48 
 
 
510 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  33.18 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  28.29 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  30.51 
 
 
575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  28.57 
 
 
510 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.52 
 
 
494 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.22 
 
 
510 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.99 
 
 
496 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  28.48 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.11 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  34.56 
 
 
496 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.95 
 
 
522 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  34.56 
 
 
496 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.18 
 
 
486 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.59 
 
 
483 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.25 
 
 
503 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.99 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.04 
 
 
569 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.94 
 
 
498 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  30.13 
 
 
494 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.61 
 
 
494 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>