More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2525 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  53.18 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.94 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  44.61 
 
 		 287 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  38.87 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  36.92 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  39.08 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  39.62 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  35.88 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.12 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.48 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  28.9 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  28.78 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  28.78 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  28.78 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.3 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  28.41 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  28.41 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  29.89 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  29.89 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  29.56 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  27.84 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  28.78 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  27.84 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  27.84 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  29.15 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  27.47 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  27.84 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  28.78 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  27.47 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  27.47 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  25.82 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  28.41 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  26.74 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  26.74 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  26.74 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  26.74 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  27.01 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  26.47 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  25.39 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.52 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  24.91 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  25.83 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  29.29 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  28.87 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  27.71 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.37 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.650618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  30.96 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.69 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.69 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.17 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  30.07 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.33 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  29.09 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  23.23 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  42.05 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.83 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  27.82 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.11 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.98 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  22.88 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  22.75 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  26.69 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  22.14 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  24.28 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>