More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1016 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.650618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.17 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.17 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.84 
 
 		 266 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.71 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  25.45 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  24.29 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.96 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  24.29 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  23.61 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.46 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.61 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  23.71 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  23.71 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.71 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.61 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  23.93 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1728  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.5 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.43 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.37 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl503  HAD-superfamily cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  22.06 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.37 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  23.26 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  22.01 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.23 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  23.53 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  23.36 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.81 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  22.55 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  23.43 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.04 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  25.36 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  22.38 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  23.97 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.81 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.94 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  23.95 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  24.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  25.82 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.62 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  22.66 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  24.57 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  23.69 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  23.95 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  23.95 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  24.22 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.2 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  24.16 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  22.18 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  23.95 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.23 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  21.9 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  24.23 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  23.95 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  23.95 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  24.23 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  24.23 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0630  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.78 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.07 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.86 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  24.3 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  23.21 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>