119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1897 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  43.2 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  39.58 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  40.89 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  42.72 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  39.61 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  35.98 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  42.13 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  41.63 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  38 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  34.3 
 
 		 191 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  32.54 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  34.35 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  34.95 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.52 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  36.23 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  34.29 
 
 		 231 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  34.41 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  32.84 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  32.83 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  34.3 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  32.21 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.21 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  32.83 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  30.35 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  32.02 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  32.06 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.1 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  30.17 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  29.65 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  31.98 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  28.33 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  28.33 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  31.79 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  29.46 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  29.83 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  30.85 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  31.16 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  30.35 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  32.63 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  32.67 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  30.5 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  29.9 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  29.9 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  29.44 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  28.28 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  29.22 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  29.22 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  26.17 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  28.71 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  30.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  30.09 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  24.23 
 
 		 197 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.69 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  24.23 
 
 		 197 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  28.35 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  28.35 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  27.54 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  29.9 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  29.59 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  30.35 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  29.85 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  26.32 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  29.48 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  23.79 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  30.7 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  29.27 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  27.04 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  26.26 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  28.12 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  43.55 
 
 		 113 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  37.65 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  24.49 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  27.05 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  43.4 
 
 		 134 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.41 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  25.25 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  46.15 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  41.82 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  25.5 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  25.94 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  35.9 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  21.76 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  21.76 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  32.41 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  26.21 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>