More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1712 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 373 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  46.87 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  46.87 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  46.87 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  45.09 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 366 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.41 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.56 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.06 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 350 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.31 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.33 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.02 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.29 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.99 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.72 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  29.32 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 265 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.07 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  28.47 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.63 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.62 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.67 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.64 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.74 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.16 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.8 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  26.04 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.49 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.02 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.08 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.27 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.53 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.18 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.42 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>