More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1113 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  83.76 
 
 		 235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  87.61 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  85.04 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  85.04 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  85.04 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  82.85 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  81.97 
 
 		 235 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  80.6 
 
 		 239 aa  367  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  73.28 
 
 		 238 aa  361  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  82.17 
 
 		 238 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  72.84 
 
 		 238 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  72.17 
 
 		 236 aa  350  8.999999999999999e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  70.51 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  79.57 
 
 		 237 aa  349  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  77.16 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  72.22 
 
 		 236 aa  345  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  73.08 
 
 		 235 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  72.65 
 
 		 235 aa  340  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  69.66 
 
 		 238 aa  340  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  75.85 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  68.53 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  69.1 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  68.38 
 
 		 236 aa  335  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  69.92 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  70.17 
 
 		 238 aa  329  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  73.25 
 
 		 237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  66.67 
 
 		 239 aa  322  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  68 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  70.87 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  68.61 
 
 		 225 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  68.7 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  65.37 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 230 aa  310  9e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  68.61 
 
 		 230 aa  307  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  63.27 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  64 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  70.48 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  61.61 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 235 aa  278  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  57.56 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 		 229 aa  277  9e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  58.47 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  62.11 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  58.72 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  61.95 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.6 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  57.99 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.94 
 
 		 233 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 232 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 233 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 235 aa  258  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  60.79 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.72 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.72 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  56.44 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.24 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  56.5 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  59.35 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 232 aa  251  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  251  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  53.19 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>