More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1066 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 368 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  47.66 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.86 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.86 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  38.08 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.61 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  28.04 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  30.37 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.13 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.2 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.29 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  32.59 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.32 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.55 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  38.53 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  24.53 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  29.1 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  27.55 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.68 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  30.41 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>