More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2252 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
401 aa  791    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  36.95 
 
 
399 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  37.19 
 
 
399 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  36.45 
 
 
399 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  36.95 
 
 
399 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  36.7 
 
 
399 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
399 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
399 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  36.7 
 
 
399 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
399 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  35.98 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  34.96 
 
 
396 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  34.7 
 
 
405 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  34.7 
 
 
396 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  34.7 
 
 
396 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  35.09 
 
 
396 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  35.09 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  31.45 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  34.63 
 
 
402 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  32.19 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  32.19 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  32.16 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
396 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  31.27 
 
 
506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  31.27 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  32.82 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  31.02 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  31.27 
 
 
506 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  30.77 
 
 
399 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  30.77 
 
 
505 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  30.86 
 
 
447 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  30.35 
 
 
400 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
391 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 
401 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.95 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
421 aa  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  28.57 
 
 
384 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  28.06 
 
 
381 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
381 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
381 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
381 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  26.92 
 
 
381 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  27.92 
 
 
381 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.35 
 
 
399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  28.33 
 
 
400 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
401 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
404 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  29.23 
 
 
397 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  28.35 
 
 
390 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  26 
 
 
403 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  26 
 
 
403 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  28.68 
 
 
405 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  28.04 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  26.33 
 
 
410 aa  120  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
410 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.09 
 
 
386 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  25.13 
 
 
391 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
419 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.93 
 
 
390 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
419 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.34 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.54 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.71 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.61 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.21 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
385 aa  89.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
415 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.58 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.53 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.58 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.58 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  22.75 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.45 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.21 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.21 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.9 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.9 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.9 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  22.83 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.42 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  25.35 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  24.63 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  25.77 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  23.43 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  23.43 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.16 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  22.4 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  24.18 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  29.19 
 
 
561 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.14 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>