131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2184 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1338  Acetamidase/Formamidase  91.47 
 
 		 434 aa  831    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.702518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2184  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 434 aa  891    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3284  Acetamidase/Formamidase  66.51 
 
 		 443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148354  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3508  acetamidase/formamidase  60.98 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3153  acetamidase/formamidase  60.75 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.121817 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4177  acetamidase/formamidase  60.28 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1872  Acetamidase/Formamidase  64.4 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2080  acetamidase/formamidase  54.46 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5699  acetamidase/formamidase  56 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2016  Acetamidase/Formamidase  51.99 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.62129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2642  Acetamidase/Formamidase  52.45 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0651  Acetamidase/Formamidase  51.05 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  34.21 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  31.16 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  34.58 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  34.21 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  35.51 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  35.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  35.51 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  35.51 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  35.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  35.51 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  26.95 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  32.26 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  29.83 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.58 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  32.71 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  34.91 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  36.84 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  35.42 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  36.84 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  36.84 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  32.35 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  36.84 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  32.35 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  35.4 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  33.96 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.12 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.74 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  43.28 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  47.69 
 
 		 311 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.96 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  36.23 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.51 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.7 
 
 		 299 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  26.5 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  30.17 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.73 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  27.03 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.69 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.73 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  34.33 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  35.71 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  40.58 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  31.34 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.09 
 
 		 314 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  40.3 
 
 		 358 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  37.5 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 483 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  40 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  30.65 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  36.47 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 810 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.79 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  37.31 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 844 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  23.19 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  25 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  30.84 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  31.06 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.15 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  35.9 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.65 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  39.19 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  33.64 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  44.07 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.01 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  28.05 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 791 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  39.19 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.64 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  35.82 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  36.49 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  36.49 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  37.84 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  37.84 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  40 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  40 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  33.78 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  33.78 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 777 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 791 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  30.39 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  40 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  28.97 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>