181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0165 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  89.12 
 
 		 298 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  81.02 
 
 		 298 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  80.13 
 
 		 298 aa  474  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  80.13 
 
 		 298 aa  474  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  80.47 
 
 		 298 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  80.13 
 
 		 298 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  79.8 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  79.8 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  80.13 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  79.8 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  79.8 
 
 		 298 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  71.48 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  71.82 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  71.82 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  66.55 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  77.11 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  51.08 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  48.46 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  49.12 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  46.23 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  47.02 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  43.79 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  46.64 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  45.39 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  42.2 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  44.37 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  44.83 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  43.01 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  42.86 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  37.06 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  38.87 
 
 		 282 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  37.36 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  37.36 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  38.66 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  37.41 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  39.1 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  38.15 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  37.32 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  38.11 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.94 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  35.47 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  34.09 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  36.96 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  34.72 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  36.05 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.47 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  34.38 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  35.74 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  37.59 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.6 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  36.5 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  37.2 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  35.47 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  32.7 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  34.22 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  37.26 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  34.85 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  35.71 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  36.26 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  34.26 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  34.59 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  34.72 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  35.34 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  36.19 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  36.12 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  33.71 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  34.25 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  33.56 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  33.58 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  33.67 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  34.59 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  37.36 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  36.26 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  34.69 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  34.69 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  34.69 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  33.9 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  34.08 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  34.97 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  33.9 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  36.26 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  34.35 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  31.95 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  34.35 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  34.35 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  34.35 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  34.35 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  34.35 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  30.51 
 
 		 379 aa  145  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  33.81 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  33.22 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  34.23 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  36.24 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  32.45 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  34.72 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>