More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0798 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0798  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  78.35 
 
 		 259 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  77.95 
 
 		 259 aa  411  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1292  ABC transporter related  72.62 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.577563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.64 
 
 		 246 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.14 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.3 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.09 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 254 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.34 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  51.75 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.96 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 267 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.38 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  54.55 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.7 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.33 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.38 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  52.99 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.17 
 
 		 259 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.97 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.96 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.78 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.57 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.15 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  50.78 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 		 592 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.38 
 
 		 263 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  53.12 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.36 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  51 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  54.33 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  52.14 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  53.54 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.78 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 		 275 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.19 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  50.78 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  52.42 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  50.59 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  52.61 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  51.39 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  51.92 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  51.39 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.39 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.99 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.99 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50.79 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  52.38 
 
 		 252 aa  258  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0345  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  50.4 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  51.81 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  50.19 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  53.39 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  52.19 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.2 
 
 		 254 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  50.6 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 		 595 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.39 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50.19 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.79 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.99 
 
 		 252 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 598 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  51.6 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50.2 
 
 		 240 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  52.36 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.79 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>