More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5615 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  41.39 
 
 
2674 aa  1053    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  50.74 
 
 
2386 aa  1307    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  43.48 
 
 
2327 aa  1298    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  64.9 
 
 
2628 aa  2063    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.22 
 
 
2260 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2816 aa  5390    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  43.82 
 
 
2553 aa  1064    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  55.55 
 
 
2314 aa  1371    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  50.63 
 
 
2614 aa  1291    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  41.53 
 
 
2503 aa  1018    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.15 
 
 
2661 aa  629  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.56 
 
 
2477 aa  619  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.47 
 
 
2300 aa  615  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
1764 aa  600  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.26 
 
 
1772 aa  600  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.95 
 
 
2771 aa  597  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.29 
 
 
2443 aa  596  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  40.24 
 
 
2298 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.34 
 
 
2249 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  40.9 
 
 
2189 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.26 
 
 
2414 aa  584  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 
1272 aa  577  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.86 
 
 
1845 aa  557  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 
2266 aa  555  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  38.31 
 
 
2448 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  36.66 
 
 
2531 aa  539  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 
2560 aa  536  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.39 
 
 
2750 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  37.24 
 
 
2619 aa  533  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  35.68 
 
 
2683 aa  532  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  35.96 
 
 
2764 aa  534  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 
2657 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 
2640 aa  534  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 
2624 aa  529  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  35.79 
 
 
2642 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  36.63 
 
 
2664 aa  527  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  36.27 
 
 
2620 aa  525  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.77 
 
 
2694 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.71 
 
 
2704 aa  524  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  35.87 
 
 
2693 aa  524  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  35.59 
 
 
2703 aa  521  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  36.83 
 
 
2542 aa  515  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.04 
 
 
1631 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.36 
 
 
1656 aa  386  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  29.66 
 
 
2754 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 
1740 aa  370  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.45 
 
 
1087 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.83 
 
 
2604 aa  367  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 
1480 aa  366  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32.15 
 
 
1413 aa  365  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  44.75 
 
 
2338 aa  363  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.18 
 
 
1337 aa  363  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  42.58 
 
 
3008 aa  361  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.57 
 
 
2462 aa  358  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  30.03 
 
 
1354 aa  356  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  28.65 
 
 
2551 aa  355  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.03 
 
 
1984 aa  355  8e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
2551 aa  353  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
1874 aa  352  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  31.14 
 
 
1574 aa  350  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  44.3 
 
 
3243 aa  349  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.06 
 
 
4080 aa  349  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.87 
 
 
6889 aa  348  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  43.87 
 
 
3115 aa  346  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 
2772 aa  345  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  33.69 
 
 
1929 aa  345  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.7 
 
 
2890 aa  345  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 
2150 aa  343  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  34.24 
 
 
1934 aa  342  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.28 
 
 
1909 aa  341  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 
2333 aa  340  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  33.68 
 
 
1935 aa  339  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  33.26 
 
 
1795 aa  339  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 
2498 aa  338  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.85 
 
 
3702 aa  338  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 
3693 aa  337  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 
3693 aa  337  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  34.32 
 
 
3424 aa  337  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
3176 aa  333  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.12 
 
 
1587 aa  332  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.48 
 
 
3099 aa  332  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  33.37 
 
 
1985 aa  332  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.76 
 
 
3676 aa  332  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.02 
 
 
1646 aa  331  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.05 
 
 
1470 aa  330  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 
3679 aa  330  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  33.95 
 
 
1535 aa  329  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.1 
 
 
1939 aa  327  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 
1828 aa  327  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.85 
 
 
1827 aa  327  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  30.86 
 
 
3449 aa  327  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  28.65 
 
 
3718 aa  326  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 
1908 aa  326  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  32.03 
 
 
1520 aa  326  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.93 
 
 
1101 aa  325  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.59 
 
 
1349 aa  325  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.17 
 
 
950 aa  324  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  33.03 
 
 
1955 aa  324  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.59 
 
 
1349 aa  324  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  29.29 
 
 
1424 aa  324  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>