More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5340 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 358 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  80.83 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  55.19 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  57.37 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  58.17 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  57.37 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  57.37 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  57.47 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  52.12 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  50.42 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  52.87 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  50.75 
 
 		 341 aa  359  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  52.57 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  52.57 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  51.96 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  51.98 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  51.83 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  53.67 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  51.42 
 
 		 341 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  53.18 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  51.52 
 
 		 338 aa  348  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  53.59 
 
 		 338 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  53.23 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  39.04 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  42.45 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  42.77 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  42.48 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  39.81 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  39.31 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.43 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  36.54 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  34.5 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  32.64 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.34 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  30.08 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.61 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  27.78 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.06 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.45 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  29.17 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.37 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  24.05 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.89 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  27.5 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.58 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.78 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.84 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  23.73 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.33 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>