More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1740 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
414 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  76.34 
 
 
444 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  59.95 
 
 
395 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  60.31 
 
 
390 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.02 
 
 
393 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.26 
 
 
399 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.38 
 
 
401 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.22 
 
 
436 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.27 
 
 
393 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  59.38 
 
 
400 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  59.11 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  59.11 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.31 
 
 
400 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  59.11 
 
 
402 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  60.32 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.08 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.69 
 
 
402 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  56.67 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.33 
 
 
416 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.85 
 
 
393 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.98 
 
 
401 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  55.16 
 
 
403 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  55.53 
 
 
399 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  60.15 
 
 
411 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  49.63 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  59.84 
 
 
429 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  50.63 
 
 
423 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  51.69 
 
 
419 aa  359  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.69 
 
 
397 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  60.05 
 
 
429 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.33 
 
 
420 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  50.63 
 
 
425 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  50.47 
 
 
428 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.61 
 
 
395 aa  336  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.53 
 
 
402 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.94 
 
 
396 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 
395 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
394 aa  331  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  47.61 
 
 
380 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.7 
 
 
398 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.44 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
395 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.12 
 
 
399 aa  325  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
400 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.65 
 
 
402 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.93 
 
 
442 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
390 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.62 
 
 
425 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.26 
 
 
430 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.62 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.41 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  47.51 
 
 
392 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  45.97 
 
 
390 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 
396 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.97 
 
 
410 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  46.6 
 
 
391 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
397 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
397 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
398 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
399 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.76 
 
 
388 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
395 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.16 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.59 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.83 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.51 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.51 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  43.2 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.59 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.74 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
401 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
398 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
398 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.42 
 
 
396 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.72 
 
 
412 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
400 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
404 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 
399 aa  298  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
400 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.01 
 
 
406 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.52 
 
 
406 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  46.34 
 
 
410 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  44.94 
 
 
391 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
403 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
375 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.61 
 
 
400 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>