More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0910 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  100 
 
 
421 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  80.76 
 
 
405 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  59.11 
 
 
393 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  58.55 
 
 
379 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  54.71 
 
 
397 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  55.12 
 
 
400 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  48.05 
 
 
390 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  46.75 
 
 
393 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  46.35 
 
 
387 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
369 aa  335  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  45.97 
 
 
389 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.07 
 
 
397 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  46.68 
 
 
395 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.69 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.97 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 
393 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  43.82 
 
 
386 aa  295  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  42.89 
 
 
391 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  45.1 
 
 
397 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  44.96 
 
 
397 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  43.67 
 
 
395 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  43.77 
 
 
409 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  43.7 
 
 
394 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  42.64 
 
 
385 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  42.13 
 
 
389 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 
382 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  40.75 
 
 
386 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  40.75 
 
 
386 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  43.23 
 
 
387 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.74 
 
 
402 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  40.75 
 
 
386 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  40.75 
 
 
386 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  40.75 
 
 
386 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 
413 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  40.75 
 
 
386 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  40.48 
 
 
386 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  43.67 
 
 
388 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  40.48 
 
 
386 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  42.19 
 
 
386 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 
381 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  42.86 
 
 
387 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  41.35 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  40.69 
 
 
394 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  41.32 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  39.39 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  41.51 
 
 
383 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  42.12 
 
 
397 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  40.79 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  40.75 
 
 
382 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  41.25 
 
 
382 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.31 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  41.24 
 
 
394 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  41.58 
 
 
391 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 
392 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  39.73 
 
 
382 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.1 
 
 
387 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  41.28 
 
 
388 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  40.57 
 
 
387 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 
384 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.36 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  42.22 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  41.43 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  38.11 
 
 
386 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 
380 aa  266  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  38.11 
 
 
386 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  39.18 
 
 
382 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  40.81 
 
 
383 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  39.14 
 
 
385 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  40 
 
 
382 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.09 
 
 
388 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  40 
 
 
382 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.35 
 
 
390 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  39.63 
 
 
386 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  38.65 
 
 
385 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  38.65 
 
 
386 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  41.94 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  41.55 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  40.43 
 
 
394 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  41.29 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  41.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  41.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  37.57 
 
 
384 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  41.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  41.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  41.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  38.87 
 
 
385 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  37.57 
 
 
386 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  41.02 
 
 
384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  39.73 
 
 
382 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  40.81 
 
 
390 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  40.48 
 
 
386 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  40.48 
 
 
390 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  40.75 
 
 
390 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  38.65 
 
 
385 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  40.75 
 
 
390 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  38.57 
 
 
391 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  38.11 
 
 
382 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 
421 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>