177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2976 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 334 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  61.83 
 
 		 212 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  55.3 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  60.5 
 
 		 495 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  41.76 
 
 		 458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.95 
 
 		 444 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  51.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  45.83 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  52.46 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  54.62 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  45.38 
 
 		 167 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  53.12 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  49.19 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  43.71 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  48.74 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.79 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  47.97 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.25 
 
 		 213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  51.61 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  45.16 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  50.83 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  46.62 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  42.58 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  43.7 
 
 		 500 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  34.87 
 
 		 276 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  47.93 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  41.18 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  45.45 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  39.07 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  39.07 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  39.07 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  38.41 
 
 		 270 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  42.98 
 
 		 245 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.26 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  42.75 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  38.35 
 
 		 220 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  45 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  38.1 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  38.5 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  40.98 
 
 		 205 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  39.86 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  39.2 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  40.94 
 
 		 244 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  40.34 
 
 		 203 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  38.02 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  36.25 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.29 
 
 		 541 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  40.26 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  40.74 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  37.04 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  42.5 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  35.86 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.65 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.81 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  34.48 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  38.93 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  36.45 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  34.59 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  39.42 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  35.34 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.46 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.73 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  30.83 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  30.83 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  36.92 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  35.54 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  33.83 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  34.4 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  34.19 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  39.42 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.97 
 
 		 450 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  34.56 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  33.6 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  33.83 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.85 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  40.37 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  36.79 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  34.33 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  34.35 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  32.33 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  33.83 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  38.81 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  33.83 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  33.79 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  39.5 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>