109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1892 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  83.75 
 
 		 186 aa  263  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  81.25 
 
 		 160 aa  256  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  63.75 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  62.5 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  66.25 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  60 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  58.75 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  58.13 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  50 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  51.59 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  50.62 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  51.88 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  53.29 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  48.75 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  46.25 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  47.65 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.12 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  47.95 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  32.7 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  32.08 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  30.43 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  30.86 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  31.01 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  31.01 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  31.01 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  31.01 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  30.38 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  30.38 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  30.38 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  31.97 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  31.97 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  31.97 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  31.29 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  29.93 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  29.93 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  44.3 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  29.01 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  30.67 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  30.77 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 674 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 662 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  46.43 
 
 		 652 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  41.94 
 
 		 664 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.31 
 
 		 350 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 668 aa  48.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  41.07 
 
 		 658 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.92 
 
 		 697 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 		 673 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  25.5 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 672 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 		 671 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 684 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 693 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  42.59 
 
 		 656 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 		 676 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  42.31 
 
 		 720 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 674 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  26.5 
 
 		 401 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 		 666 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.93 
 
 		 371 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.51 
 
 		 581 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 666 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 233 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  32.71 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.51 
 
 		 335 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  29.85 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>