77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1302 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.65 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1259  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.239983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  46.84 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  24.76 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  24.27 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 458 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 		 366 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  48.15 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  38.36 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  44.29 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  38.36 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.14 
 
 		 1635 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  28.02 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  32.26 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1043  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.22 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 1398 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  40.58 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 1243 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 443 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.96 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  46.3 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  46.3 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 459 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3308  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000927937  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 377 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 846 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.27 
 
 		 846 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 		 967 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>