More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0926 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  38.65 
 
 		 2327 aa  1623    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  50.15 
 
 		 2386 aa  1476    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2628 aa  5054    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  44.04 
 
 		 2553 aa  1115    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  51.45 
 
 		 2314 aa  1604    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.75 
 
 		 2661 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  42.2 
 
 		 2503 aa  1028    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  43.16 
 
 		 2674 aa  1097    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  66.11 
 
 		 2816 aa  1992    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  52.68 
 
 		 2614 aa  1324    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.48 
 
 		 2477 aa  606  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 		 1272 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.51 
 
 		 2443 aa  595  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.06 
 
 		 2300 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  37.16 
 
 		 1764 aa  593  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.32 
 
 		 1772 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.39 
 
 		 2414 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  40.91 
 
 		 2298 aa  590  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.48 
 
 		 2249 aa  583  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  40.27 
 
 		 2260 aa  570  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  39.04 
 
 		 2189 aa  561  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  40.57 
 
 		 2266 aa  560  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 		 2640 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  38.06 
 
 		 2620 aa  552  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  36.77 
 
 		 2683 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 		 2657 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 2619 aa  550  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  36.61 
 
 		 2531 aa  546  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.33 
 
 		 2694 aa  546  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.2 
 
 		 2750 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.47 
 
 		 2704 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 2664 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  36.22 
 
 		 2703 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  36.91 
 
 		 2642 aa  546  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  36.23 
 
 		 2693 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  36.94 
 
 		 2764 aa  545  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.68 
 
 		 1845 aa  544  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 2624 aa  539  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  40.66 
 
 		 2560 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  38.45 
 
 		 2448 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  40.69 
 
 		 2338 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  37.27 
 
 		 2542 aa  517  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  35.77 
 
 		 3008 aa  516  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.4 
 
 		 2771 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  37.58 
 
 		 1631 aa  477  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 2772 aa  457  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  30.74 
 
 		 2754 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.12 
 
 		 1656 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  36.31 
 
 		 1480 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 		 1453 aa  383  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 		 1740 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.46 
 
 		 1984 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.63 
 
 		 4080 aa  362  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  35.35 
 
 		 1733 aa  358  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  34.3 
 
 		 1934 aa  358  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.75 
 
 		 1087 aa  356  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  34.25 
 
 		 1935 aa  355  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  34.88 
 
 		 1929 aa  355  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  35.96 
 
 		 3424 aa  353  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.06 
 
 		 2462 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.97 
 
 		 2551 aa  353  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 		 3176 aa  352  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  34.29 
 
 		 2498 aa  351  8e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.3 
 
 		 1795 aa  351  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 2551 aa  348  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  44.19 
 
 		 3115 aa  347  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.26 
 
 		 2604 aa  344  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.9 
 
 		 1337 aa  344  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  44.19 
 
 		 3243 aa  344  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 		 1470 aa  342  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 		 4101 aa  342  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 		 1939 aa  340  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 		 3679 aa  340  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 1908 aa  338  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 3254 aa  338  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  29.83 
 
 		 2176 aa  337  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.27 
 
 		 4478 aa  337  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.04 
 
 		 3099 aa  335  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.92 
 
 		 950 aa  335  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.27 
 
 		 1985 aa  334  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.85 
 
 		 1827 aa  333  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.47 
 
 		 3693 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  30.19 
 
 		 1354 aa  333  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.47 
 
 		 3693 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.78 
 
 		 3702 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.7 
 
 		 6889 aa  333  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 1874 aa  333  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 		 1587 aa  333  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 		 2333 aa  333  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.38 
 
 		 1372 aa  333  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  33.68 
 
 		 1923 aa  333  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  33.12 
 
 		 1466 aa  330  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 1832 aa  330  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 7110 aa  329  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 		 1951 aa  329  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  30.51 
 
 		 1653 aa  328  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 		 1144 aa  328  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 		 1574 aa  328  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 		 1535 aa  328  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.07 
 
 		 1101 aa  327  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>