219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0447 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  100 
 
 		 146 aa  283  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  73.53 
 
 		 206 aa  146  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  57.58 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  46.34 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  60.71 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  73.08 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  67.07 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  56.63 
 
 		 155 aa  94  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  61.11 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  48.89 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  46.96 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  50.57 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  60 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.2 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  33.88 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  47.06 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  39.8 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  37.21 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  32.32 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  39.44 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  39.74 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  31.43 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  29.76 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.14 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  32.38 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  39.44 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  37.5 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  31.87 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  32.65 
 
 		 144 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.53 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.53 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  31.53 
 
 		 289 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  24.1 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  33.71 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  30.51 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  42.25 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  26.96 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  28.17 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  46.88 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  25.77 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  24.68 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  30.77 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.14 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  30.11 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.97 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  28.17 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  26.42 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  35.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.46 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  30.77 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  30.77 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.71 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.88 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  37.84 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  31.96 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  31.43 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 449 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  27.42 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  30.36 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  40.58 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33.72 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.72 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  38.27 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  26.92 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  31.46 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  28.57 
 
 		 421 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.95 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  30.56 
 
 		 286 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  26.53 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  26.72 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  31.58 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  33.71 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  32.17 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  31.11 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>