166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0806 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0806  surface antigen (D15)  100 
 
 
737 aa  1462    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0916  surface antigen  39.22 
 
 
727 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.733535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0487  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
711 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00051966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0472  surface antigen (D15)  25.27 
 
 
711 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000471704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1228  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.84 
 
 
763 aa  96.3  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  26.04 
 
 
739 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.35 
 
 
772 aa  76.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.25 
 
 
888 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  21.65 
 
 
784 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.65 
 
 
784 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  26.04 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  24.57 
 
 
553 aa  73.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  25.6 
 
 
739 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.92 
 
 
781 aa  70.9  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.97 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  22.68 
 
 
826 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  22.82 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  22.82 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  21.97 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  21.97 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  21.97 
 
 
827 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  22.22 
 
 
826 aa  65.1  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.28 
 
 
769 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.63 
 
 
807 aa  64.3  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  21.56 
 
 
758 aa  64.3  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  21.43 
 
 
796 aa  63.9  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  22.01 
 
 
803 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  22.39 
 
 
807 aa  63.9  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  21.51 
 
 
826 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.03 
 
 
787 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  20.84 
 
 
790 aa  62.4  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.32 
 
 
805 aa  62.4  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.9 
 
 
768 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.85 
 
 
827 aa  61.6  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.15 
 
 
800 aa  62  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.33 
 
 
780 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  20.8 
 
 
768 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  20.92 
 
 
769 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  20.92 
 
 
769 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.61 
 
 
560 aa  61.2  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  23.82 
 
 
778 aa  61.2  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.92 
 
 
769 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.81 
 
 
810 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.02 
 
 
815 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  20.58 
 
 
769 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  20.55 
 
 
788 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.12 
 
 
765 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.81 
 
 
892 aa  59.7  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.86 
 
 
810 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.12 
 
 
758 aa  59.3  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  21.57 
 
 
893 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.86 
 
 
810 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01381  outer membrane protein, OMP85 family  22.44 
 
 
825 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0183753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  25.71 
 
 
830 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.67 
 
 
810 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  20.05 
 
 
768 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.57 
 
 
769 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  20.57 
 
 
818 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.82 
 
 
770 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.83 
 
 
769 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
769 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
769 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
768 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.88 
 
 
809 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  19.24 
 
 
784 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  19.41 
 
 
791 aa  57.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  21.19 
 
 
827 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.1 
 
 
827 aa  57.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  22.72 
 
 
834 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
769 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  22.05 
 
 
820 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
768 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
768 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  20.69 
 
 
768 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.51 
 
 
770 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  20.54 
 
 
913 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  21.56 
 
 
744 aa  56.2  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  20.57 
 
 
827 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.27 
 
 
750 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  22.05 
 
 
852 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.53 
 
 
801 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  20.15 
 
 
765 aa  55.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.03 
 
 
804 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  20.19 
 
 
896 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  20.32 
 
 
767 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  21.85 
 
 
848 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  21.26 
 
 
844 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.49 
 
 
800 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  20.76 
 
 
763 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.64 
 
 
836 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  22.07 
 
 
802 aa  54.7  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.73 
 
 
920 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>