More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0571 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0571  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5062  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 
394 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
394 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
426 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
387 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
365 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
536 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
386 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.88 
 
 
431 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
373 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
415 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
387 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  25.26 
 
 
387 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
419 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
377 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
424 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.66 
 
 
419 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
365 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
355 aa  58.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
366 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
377 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
422 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
411 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.21 
 
 
400 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
370 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
426 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
394 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
386 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
374 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
374 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
386 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
393 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
425 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  28.93 
 
 
345 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.5 
 
 
374 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
357 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
356 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
395 aa  54.7  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
398 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3930  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
423 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
376 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
382 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
394 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
377 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  26.24 
 
 
391 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
379 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
413 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.33 
 
 
430 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  28.66 
 
 
393 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
381 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
384 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  23.17 
 
 
418 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 
401 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
426 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.98 
 
 
377 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  24 
 
 
480 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  25.38 
 
 
413 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
393 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  25.43 
 
 
431 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
398 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  21.29 
 
 
371 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
387 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
395 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
387 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
367 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
399 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  24.71 
 
 
450 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.99 
 
 
394 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
385 aa  51.6  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
391 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
386 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  31.65 
 
 
745 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
412 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  30.38 
 
 
745 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
370 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
382 aa  51.2  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
381 aa  51.2  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
385 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
373 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
470 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
394 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.19 
 
 
392 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
375 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
370 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
396 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
382 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
689 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.22 
 
 
380 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
344 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
378 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
379 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>