60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4751 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 345 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  50 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  47.49 
 
 		 359 aa  335  5e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  47.77 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  48.21 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  28.19 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  23.2 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.95 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.51 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  25.36 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  24.78 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  23.24 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.42 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.69 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  23.3 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  22.11 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.84 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.33 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  22.15 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  22.29 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.42 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  26.87 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.25 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.95 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  22.53 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  25.27 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  27.59 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.43 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.77 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  21.28 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.26 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  21.21 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.94 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  24.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.7 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.05 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0570  hypothetical protein  20.35 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.68 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  23.03 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  17.5 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  20.72 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  21.43 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.53 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.73 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  20.64 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  22.44 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  19.01 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  19.2 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  20.39 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  20.33 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.51 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.14 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  25.41 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  20.33 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  20.96 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>