More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1046 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
335 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  50.91 
 
 
331 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  48.05 
 
 
345 aa  309  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  46.61 
 
 
355 aa  291  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  42.82 
 
 
350 aa  278  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  38.3 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  34.59 
 
 
296 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.98 
 
 
359 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.26 
 
 
516 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  27.89 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  23.55 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.56 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.33 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
347 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  24.56 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  25.71 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.88 
 
 
349 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.88 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.78 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.78 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.14 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.93 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  23.7 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  24.31 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  24.31 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  23.16 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.3 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  25.26 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  24.13 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.96 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.07 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  23.78 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.65 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.35 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  23.63 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.35 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.46 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.58 
 
 
779 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  23.39 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  27.15 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  25.52 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  23.76 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.38 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.45 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.59 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.34 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.55 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  22.97 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.68 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.78 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.96 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  20.42 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  22.98 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.97 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.05 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.97 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  23.21 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  21.92 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.72 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  22.25 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.43 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  22.14 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.19 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.89 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.22 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  21.02 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  24.15 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.15 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.15 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>