66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4234 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  816    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  77.51 
 
 
410 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  58.13 
 
 
407 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  51.6 
 
 
407 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  51.6 
 
 
407 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  39.09 
 
 
408 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  38.4 
 
 
399 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  38 
 
 
399 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  36.16 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
427 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  30.81 
 
 
410 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  32.59 
 
 
396 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  30.56 
 
 
396 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  29.4 
 
 
399 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  31.2 
 
 
396 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  34.47 
 
 
609 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
399 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
700 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.33 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 
878 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.54 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  25.35 
 
 
838 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
852 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.15 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  24.63 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 
917 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.38 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.09 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  27.62 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  21.46 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  23.1 
 
 
597 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  24.51 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
855 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  24.26 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  26.58 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  26.58 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  26.58 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  25.44 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  26.58 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  30.28 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  30.23 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.36 
 
 
1232 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
856 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  21.99 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.75 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.44 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  22.86 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.4 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
861 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.92 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.4 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 
401 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  28.05 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.69 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  24.43 
 
 
401 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
398 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.32 
 
 
417 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  24.58 
 
 
488 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.65 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1812  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.17 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0248293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>