125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1668 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
609 aa  1197    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  37.5 
 
 
407 aa  128  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
410 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  35.35 
 
 
427 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  34.47 
 
 
410 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  36.92 
 
 
397 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  36.53 
 
 
399 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  36.28 
 
 
399 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  31.72 
 
 
407 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  32 
 
 
410 aa  98.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  36.09 
 
 
395 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  28.89 
 
 
407 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  40.78 
 
 
408 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  29.77 
 
 
396 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  29.77 
 
 
396 aa  90.5  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  31.16 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
700 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  30.88 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  30.32 
 
 
488 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.32 
 
 
418 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.59 
 
 
417 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.82 
 
 
414 aa  57.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.45 
 
 
418 aa  57.4  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
421 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.57 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.57 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
386 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.41 
 
 
414 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  29.68 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  29.68 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  29.68 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  29.68 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  29.68 
 
 
417 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.73 
 
 
439 aa  53.9  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  29.33 
 
 
422 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
417 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  29.03 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
397 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.74 
 
 
417 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  27.74 
 
 
417 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.94 
 
 
413 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.89 
 
 
418 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.08 
 
 
416 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  35.42 
 
 
408 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.9 
 
 
423 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  31.94 
 
 
413 aa  51.6  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.39 
 
 
417 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  20.12 
 
 
394 aa  50.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 
413 aa  50.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.68 
 
 
415 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.74 
 
 
417 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  27.34 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.12 
 
 
423 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.56 
 
 
418 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.21 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1014  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.52 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.4 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  28.68 
 
 
395 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  25.6 
 
 
376 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.86 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.91 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.21 
 
 
416 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  32.54 
 
 
414 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.52 
 
 
416 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.81 
 
 
862 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3181  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.03 
 
 
420 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 
386 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.57 
 
 
414 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 
378 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.1 
 
 
417 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.57 
 
 
414 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  31.25 
 
 
409 aa  47.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
386 aa  47.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 
466 aa  47.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.07 
 
 
387 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  23.29 
 
 
404 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  41.86 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  25.52 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  27.45 
 
 
813 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
398 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  33.33 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.82 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  33.33 
 
 
416 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  28.47 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  27.45 
 
 
386 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 
385 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2755  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.08 
 
 
417 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3256  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.21 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.9 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  35.04 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  29.69 
 
 
787 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.31 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  28.68 
 
 
414 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>