19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3149 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  33.67 
 
 		 410 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  30.81 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  32.6 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  32.79 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  32.51 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  33.24 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  34.91 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  33.94 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  30.96 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  31.2 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  30.41 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  31.62 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 609 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  30.12 
 
 		 396 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>