25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1840 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  800    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  41.41 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  41.96 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  39.09 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  39.07 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  38.14 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  40.92 
 
 		 427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  36.91 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  40.76 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  39.55 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  40.25 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  32.45 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  32.38 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  33.58 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  32.41 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  32.33 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 		 609 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 700 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.2 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  31.45 
 
 		 835 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  29.29 
 
 		 835 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0571  hypothetical protein  25.8 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  28.71 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>