More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0281 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  93.55 
 
 
715 aa  1103    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  93.37 
 
 
715 aa  1103    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.16 
 
 
716 aa  764    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  93.56 
 
 
559 aa  1107    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.95 
 
 
808 aa  649    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  62.23 
 
 
716 aa  744    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.18 
 
 
715 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.62 
 
 
716 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  60.47 
 
 
715 aa  728    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  61.91 
 
 
713 aa  732    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.23 
 
 
716 aa  772    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 
559 aa  1171    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.73 
 
 
723 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  93.55 
 
 
715 aa  1103    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.04 
 
 
718 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  93.73 
 
 
715 aa  1107    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.49 
 
 
716 aa  794    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  61 
 
 
715 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  93.73 
 
 
715 aa  1107    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  93.73 
 
 
715 aa  1107    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  53.39 
 
 
737 aa  617  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.05 
 
 
677 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.26 
 
 
541 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.8 
 
 
676 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.95 
 
 
676 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.32 
 
 
674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.09 
 
 
893 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.43 
 
 
676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.51 
 
 
674 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  42 
 
 
527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.43 
 
 
674 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.98 
 
 
893 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  42.15 
 
 
745 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  42.54 
 
 
529 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  41.81 
 
 
526 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 
917 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
674 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  41.64 
 
 
581 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  40.85 
 
 
695 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  41.28 
 
 
527 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.12 
 
 
900 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  41.09 
 
 
536 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.13 
 
 
899 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 
945 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 
901 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
893 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 
900 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.04 
 
 
688 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 
904 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 
879 aa  418  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  39.3 
 
 
689 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  40.9 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.82 
 
 
906 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.07 
 
 
689 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2945  molybdopterin oxidoreductase  40.71 
 
 
542 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.75 
 
 
687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  39 
 
 
724 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.19 
 
 
685 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.92 
 
 
937 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.3 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 
686 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.45 
 
 
911 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.68 
 
 
944 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.93 
 
 
1385 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 
925 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.08 
 
 
686 aa  392  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.96 
 
 
920 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  39.21 
 
 
527 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.7 
 
 
905 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.1 
 
 
688 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 
898 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.02 
 
 
685 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.48 
 
 
1440 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 
959 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  38.1 
 
 
687 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 
528 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 
1000 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 
967 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 
1410 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.17 
 
 
956 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 
956 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.66 
 
 
957 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 
927 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.29 
 
 
947 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 
963 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 
948 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.83 
 
 
977 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 
957 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.38 
 
 
909 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.41 
 
 
966 aa  369  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 
1130 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 
948 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 
903 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 
952 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.74 
 
 
979 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.07 
 
 
949 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  38.49 
 
 
982 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 
960 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.3 
 
 
982 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>