More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1098 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1098  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  739    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.516502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.11 
 
 		 355 aa  342  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 370 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.85 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  48.92 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  47.15 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48.7 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  48.72 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.21 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.21 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  49.19 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  50.68 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  45.93 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  50.35 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  44.71 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  45.26 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.22 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 357 aa  312  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  49.36 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  46.27 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 361 aa  308  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  47.3 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  43.1 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  44.14 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  44.25 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  44.25 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  45.57 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 357 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  42.2 
 
 		 356 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  43.84 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  45.32 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.3 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  44.08 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.03 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  45.71 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  49.68 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 351 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  47.2 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 357 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  45.27 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  48.24 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  45.12 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  49.65 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  45.62 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  44.58 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 357 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  44.95 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  43.66 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  46.63 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  45.62 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  44.05 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  43.29 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  43.06 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  42.69 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  44.65 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  45.08 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  44.76 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  43.53 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  49.35 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  44.25 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  45.08 
 
 		 355 aa  298  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  48.24 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  46.1 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  46.1 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  44.05 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>