53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1087 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  100 
 
 
612 aa  1214    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  26.64 
 
 
1070 aa  68.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  24.61 
 
 
874 aa  63.9  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.29 
 
 
737 aa  58.9  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  26.34 
 
 
1065 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.93 
 
 
467 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.58 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  24.76 
 
 
1065 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  23.95 
 
 
1090 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  24.26 
 
 
459 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.5 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.35 
 
 
446 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  29.58 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25 
 
 
461 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  24.55 
 
 
590 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  29.52 
 
 
404 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.67 
 
 
773 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28.71 
 
 
404 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28.71 
 
 
404 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  25.41 
 
 
413 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28.71 
 
 
404 aa  51.2  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  29.38 
 
 
404 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  27.63 
 
 
607 aa  50.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  26.1 
 
 
415 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.71 
 
 
389 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  25.24 
 
 
461 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  26.42 
 
 
563 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  31.25 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.34 
 
 
440 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  29.56 
 
 
589 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.74 
 
 
498 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  24.46 
 
 
480 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
661 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.1 
 
 
464 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  27.46 
 
 
586 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.6 
 
 
393 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  24.43 
 
 
443 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  26.9 
 
 
594 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.71 
 
 
754 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  21.4 
 
 
437 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25.93 
 
 
579 aa  44.3  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  26.92 
 
 
593 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  20.89 
 
 
595 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  26.42 
 
 
595 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  37.84 
 
 
569 aa  43.9  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  29.7 
 
 
595 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.75 
 
 
501 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>