49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2240 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  100 
 
 		 1107 aa  2192    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  47.83 
 
 		 1923 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  88.81 
 
 		 1951 aa  1868    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  68.83 
 
 		 1984 aa  817    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  47.83 
 
 		 1941 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  53.56 
 
 		 1940 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  54.86 
 
 		 1982 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.42 
 
 		 2216 aa  97.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.28 
 
 		 2370 aa  91.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.22 
 
 		 2225 aa  79.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.73 
 
 		 2065 aa  78.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0966  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.29 
 
 		 2844 aa  72.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  22.53 
 
 		 2276 aa  72  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.09 
 
 		 2209 aa  71.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  22.6 
 
 		 2091 aa  70.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.79 
 
 		 2437 aa  69.7  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.46 
 
 		 2739 aa  69.7  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.74 
 
 		 2760 aa  69.3  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.8 
 
 		 2123 aa  67.4  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.68 
 
 		 2114 aa  67  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.63 
 
 		 2786 aa  67  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.69 
 
 		 2267 aa  66.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.84 
 
 		 2407 aa  65.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.22 
 
 		 2435 aa  65.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.51 
 
 		 2800 aa  65.1  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 		 2596 aa  64.3  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.36 
 
 		 2237 aa  63.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.56 
 
 		 2655 aa  62.4  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.15 
 
 		 2756 aa  60.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0983  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.04 
 
 		 2309 aa  60.1  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 2083 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.94 
 
 		 2310 aa  59.7  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.91 
 
 		 1251 aa  59.7  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.26 
 
 		 2305 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.62 
 
 		 2210 aa  55.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0988  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 		 2270 aa  55.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.81 
 
 		 2747 aa  55.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.54 
 
 		 2263 aa  52.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.96 
 
 		 1256 aa  52  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3391  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.32 
 
 		 2788 aa  51.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.93 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.15 
 
 		 2751 aa  48.5  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21 
 
 		 3705 aa  48.5  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.62 
 
 		 3790 aa  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2290  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.79 
 
 		 2229 aa  47.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3371  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.84 
 
 		 2245 aa  47  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  20.4 
 
 		 2656 aa  45.8  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.8 
 
 		 2321 aa  46.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  30.94 
 
 		 2407 aa  45.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>