More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0475 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0551  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  87.97 
 
 
449 aa  784    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0377255  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0475  signal recognition particle protein  100 
 
 
448 aa  900    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.221272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1080  signal recognition particle protein  64.59 
 
 
447 aa  556  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  50.81 
 
 
551 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.06 
 
 
491 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  48.28 
 
 
504 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  48.13 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.62 
 
 
491 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  49.88 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.47 
 
 
505 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.93 
 
 
504 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  48.13 
 
 
511 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  48.47 
 
 
505 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  46.93 
 
 
512 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  50.12 
 
 
523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  50.12 
 
 
523 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.43 
 
 
515 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  48.36 
 
 
504 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  46.67 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  47.66 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  46.56 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  47.66 
 
 
522 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  49.18 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  47.56 
 
 
461 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  47.34 
 
 
458 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  47.8 
 
 
467 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  46.12 
 
 
446 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  46.43 
 
 
520 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  50.71 
 
 
523 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  47.22 
 
 
446 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  47.11 
 
 
458 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  46.21 
 
 
520 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  48.27 
 
 
514 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  45.56 
 
 
469 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  47.58 
 
 
521 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  47 
 
 
458 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  47.82 
 
 
511 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  48.71 
 
 
501 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  44.95 
 
 
443 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  47.86 
 
 
453 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  44.83 
 
 
461 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  47 
 
 
458 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  47.81 
 
 
514 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  48.04 
 
 
517 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  46.43 
 
 
520 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  48.62 
 
 
516 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  44.91 
 
 
508 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  45.52 
 
 
449 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  45.52 
 
 
449 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  48.82 
 
 
527 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  46.99 
 
 
513 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  49.41 
 
 
514 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.01 
 
 
514 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.58 
 
 
522 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  45.52 
 
 
449 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  45.12 
 
 
518 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  42.83 
 
 
445 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  45.75 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  46.99 
 
 
443 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0057  signal recognition particle protein  46.44 
 
 
455 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  48.94 
 
 
525 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0047  signal recognition particle protein  46.67 
 
 
455 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.47 
 
 
447 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0540  signal recognition particle protein  44.07 
 
 
449 aa  384  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.733534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  44.84 
 
 
444 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.43 
 
 
446 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  43.36 
 
 
448 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  43.81 
 
 
449 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  48.71 
 
 
526 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  45.84 
 
 
448 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  43.96 
 
 
462 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  44.95 
 
 
515 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  44.32 
 
 
492 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  47.43 
 
 
515 aa  378  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  44.08 
 
 
453 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  43.39 
 
 
450 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  44.21 
 
 
457 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  42.48 
 
 
449 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1150  signal recognition particle protein  46.76 
 
 
458 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  45.29 
 
 
451 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02143  signal recognition particle protein  45 
 
 
460 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.42 
 
 
447 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.04 
 
 
511 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.52 
 
 
512 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.76 
 
 
501 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  43.81 
 
 
515 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  46.06 
 
 
458 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  41.47 
 
 
479 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.36 
 
 
481 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  45.24 
 
 
444 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  46.03 
 
 
449 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  42.86 
 
 
455 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  43.88 
 
 
485 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>