281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0111 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
273 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  70.33 
 
 
273 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  69.96 
 
 
273 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  69.96 
 
 
273 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  69.96 
 
 
273 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  65.19 
 
 
273 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  65.19 
 
 
273 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  65.19 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  64.81 
 
 
273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  44.53 
 
 
276 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
276 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  43.38 
 
 
285 aa  224  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  43.4 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  39.11 
 
 
284 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 
284 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  34.59 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  34.09 
 
 
256 aa  158  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
270 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
282 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  32.24 
 
 
373 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  38.04 
 
 
366 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
278 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  28.14 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
279 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 
336 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
319 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 
271 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
373 aa  99.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.44 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.46 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  29.82 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
371 aa  95.5  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.51 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.1 
 
 
306 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
383 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  25.75 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  25.75 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
401 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
234 aa  85.5  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.05 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.45 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
659 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.05 
 
 
409 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
660 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.05 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.03 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  29.03 
 
 
665 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
336 aa  82  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.63 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 
659 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.03 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.62 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  27.31 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
673 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  28.22 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.94 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  28.22 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.64 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  25.93 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>