More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1933 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 353 aa  718    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  59.88 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  27.37 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  27.21 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  43.17 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.83 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  23.32 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.26 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  31.76 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.65 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.4 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  37.4 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.65 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  35.34 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.34 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.65 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  35.34 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.98 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  34.59 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.65 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.98 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  29.25 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.11 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.73 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  38.83 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.26 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  38.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.52 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.52 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.52 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.52 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  39.66 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  32.19 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  39.42 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  30.13 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>